En "Juan Martín el Empecinado" (1874), sin abandonar la trama guerrillera, Galdós retoma el relato de los amores entre Inés y Gabriel Araceli, al hilo de episodios anteriores desde "La Corte de Carlos IV" (tomo I de esta colección). El autor da cabida a un tipo de confrontación bélica, la guerrilla, desatendido en el resto de episodios y resalta su importancia para expulsar a los franceses, al tiempo que señala el daño que su estela provocó en la política nacional. Para mostrar esta doble visión escogió al guerrillero que más altura moral le merecía, el Empecinado, famoso por sus acciones heroicas y su calidad humana. En su larga extensión, "La batalla de los Arapiles" (1875), cuenta muchas más cosas que lo acontecido durante la contienda que, a juicio del autor, marca el final de la Guerra de la Independencia. Esta novela epistolar une el relato histórico con la recopilación de las diversas tramas que iban quedando abiertas en los nueve episodios anteriores y de esta manera sirve de cierre para la primera serie de los "Episodios nacionales".